我国20多年前就已开始对排污许可证管理制度的探索，而且国内多个省市也建立了排污许可证制度，但因形式大于内容，操作过于简单化，不够精细，最后只成为一张纸。那么如何真正建立起现代排污许可证制度？
1、要从国家层面对排污许可证制度进行梳理，系统研究现在排污许可证制度执行的现状，找出问题和不足。通过许可证把环境像资源一样精细化管理起来，从前期到中间再到末端、企业产生到成长再到消亡，进行生命周期管理。东莞环保专家提醒做好制度的框架设计很关键，要抓好两件事：一是要研究针对固定源建立以许可证为核心的体系以及许可证的详细设计，不要等到条例出台以后才去做这事儿。二是要推动不同介质分开，体现精细化管理，管好、管严、管出成效应是我们努力的方向。
2、要改变观念。实现条理化管理，许可证是一个很好的切入点和环境管理主线。政府部门需要从公共产品和环境质量的高度去认识制度的重要性，坚定信心去推这项制度；环保部门要做好积极准备，一是技术准备，二是从思想上真正把排污许可证作为环境管理的核心制度来建立；企业层面要提高认知度，许可证制度绝对不是再给企业增加枷锁，而是企业守法排污的法律证据。
3、对于许可证制度的执行，各级权限要清楚。国家主要负责制定规则，省一级则监督执行，许可的执行应该在市一级，体现权利和义务的统一。如果责权不清，就很容易乱。我认为有必要建立单独的排污许可证管理部门，包括监督管理和统筹协调都要有专门机构。
      从具体实践看，建议先实行试点示范，鼓励一些地方按照现代许可证制度先管起来。这既是对原来流于形式的制度的修正，也是制度创新。同时也要思考如何合理面对我国现在机制上的障碍，实现制度之间的配合。
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